Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCAP28676 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCAP28676 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCAP28676 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GCAP28676 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GCAP28676 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms