Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELK4P28324 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms