Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms