Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SPI1P17947 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPI1P17947 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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