Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms