Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB3P14651 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms