Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms