Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCF2P10911 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms