Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3P10147 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms