Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms