Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIT2O94813 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIT2O94813 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms