Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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