Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF14O43557 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF14O43557 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms