Protein–RNA interactions for Protein: O43399

TPD52L2, Tumor protein D54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L2O43399 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52L2O43399 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms