Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms