Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA5O15230 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms