Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms