Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP17L13C9JLJ4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms