Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms