Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNSTRNQ9Y448 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNSTRNQ9Y448 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms