Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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