Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX7Q9UNH6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms