Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms