Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms