Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms