Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLH3Q9UHC1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms