Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms