Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COMMD8Q9NX08 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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