Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf109Q9NX04 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms