Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms