Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZX9

TWSG1, Twisted gastrulation protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWSG1Q9GZX9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWSG1Q9GZX9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms