Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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