Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms