Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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