Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms