Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms