Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms