Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBPQ99417 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms