Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms