Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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