Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPR78Q96P69 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPR78Q96P69 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms