Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms