Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms