Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP47Q96K76 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms