Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms