Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms