Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms