Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms