Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA4Q8WW22 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms