Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NLGN4YQ8NFZ3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLGN4YQ8NFZ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms